2009-07-01から1ヶ月間の記事一覧

Log2とLinearの話〜GeneSpringGX10

GeneSpringGX10はデータをLog2に変換してノーマライズ、インポートをします。 ここで思いつくのが、「なんでLog2にしてしまうの?」ということです。 いわゆる「ソフトの仕様です」だそうですが...(笑) この為、GeneSpringGX10の遺伝子変動折れ線グラフ上…

MacでフォーマットされたMOをWindowsで読み込むには?

古いOSのMacでフォーマットされているMOが Windowsで読めないという状況、有りますか? 昔のデータがMOにあるけど、Macが無いよー…そんな時。 「MacDrive」というソフトで解決できます。 お金かかりますが、体験版なら一週間だけタダです。 ・体験版をインス…

映画『私は猫ストーカー』

http://www.nekostalker.jp/ 猫好き必見。公式Webでアイコンクリックすると鳴き声が出るので 飼い猫が落ち着き無くウロウロ。

Let's 夏の快眠

夏はエアコンで体が冷えたり、外気温と室温の差が 激しいため、疲れやすく、体温調節の機能が低下しがちに。 この体温調節機能の低下が眠りにくさの原因の一つです。お風呂で体を温めると、体温の上昇を抑えようと 熱放散が盛んになり発汗作用との相乗効果で…

次世代シークエンスのデータ解析

どうやらRPKM(Reads Per Kilobase exon Model per million mapped reads) が重要みたいです。まだまだ調べないといけません... 統計アルゴリズムの1種??参考URL http://www.filgen.jp/Product/BioScience21-software/index11-g.htm下記にmRNA seqのDigita…

記事:猫は人間の「脆弱性」を利用している

http://www.mypress.jp/v2_writers/beep/story/?story_id=1844579 http://news.bbc.co.uk/2/hi/science/nature/8147566.stm猫のゴロゴロ鳴き声は、飼い主を操る? 言われてみれば確かに...(笑)

パスウェイのメモ:KEGGとBioPAX

●KEGGは京都大学の生命システム情報統合データベースです。 http://www.genome.jp/kegg/ http://www.genome.jp/ja/gn_kegg_ja.html ●BioPaxはパスウェイデータフォーマットの標準化を目指す オープンコミュニティーです。 http://www.biopax.org/ これまでに…

論文検索:HighWire Press

http://highwire.stanford.edu/スタンフォード大学のライブラリーで、 検索する論文発表年数やPubMedを検索先に含む様に指定したり、 色々注文できます。 最古の論文は1753年(!)からサーチ出来る様ですね。 以下はサイトのトップページ原文です。 A divis…

アンケート:マイクロアレイデータ解析手法の一般論は有るのか?

http://enq-maker.com/result/atizHI5 こちらで日々集計中です。 GeneSpringGXでの解析ワークフローで迷われた時の ちょっとした参考にして頂ければ幸いです。

microRNAからの情報検索

「ARGONAUTE 2」 http://www.ma.uni-heidelberg.de/apps/zmf/argonaute/ ドイツのハイデルベルグ大学で作成されているデータベースで、 哺乳類のmicroRNAとターゲット以外にも、組織別発現情報や 既知の機能情報等が収集されているそうです。トップページか…