下記はPCAについて教えていただいたメールより転載致します。 主成分分析（Principal Component Analysis：PCA）についてPCA は、多次元空間の解析を少ない次元に落とし込むことで、 Complexity を減少させる手法です。 また、クラスタリングと同様、雑多な…

しばらく何も書いてませんでした･･･今年もよろしくお願いします。 先週GeneSpringGX Version11がUpdateして11.0.1になりました。 アレコレ試していますが細かなバグ修正がなされた様な。 安定まで今しばらく時間が必要な気がします。

遂にリリースされました。 が、パソコンの搭載メモリによってはアップデートすると起動しない場合が有ります。 GeneSpringアイコンダブルクリックしても動かない、という場合の 改善方法はこちら↓【Windowsデフォルトのインストール場所の場合】 C:\Program …

先日リリースされたWindows7、既に導入された方もいると思います。 とりあえず触る機会が有ったのでアレコレいじってみました。 色々バージョンが有りますが、今回使ってみたのは Windows7 Ultimate 64bit版です。 結論として、結構快適です。 メモリ2GB、デ…

Mac OS10.5＆10.6でGeneSpringGX10が動くようになったと事です。 ★動作環境がアップデートされました。 MAC Version (32 bit) Mac OS X (10.4.x Tiger, 10.5.x Leopard, 10.6.x Snow Leopard) JVM 1.5.0_05 or higher 1GB RAM or higher 1GB available disk …

GeneSpringGX10はデータをLog2に変換してノーマライズ、インポートをします。 ここで思いつくのが、「なんでLog2にしてしまうの？」ということです。 いわゆる「ソフトの仕様です」だそうですが...（笑） この為、GeneSpringGX10の遺伝子変動折れ線グラフ上…

●KEGGは京都大学の生命システム情報統合データベースです。 http://www.genome.jp/kegg/ http://www.genome.jp/ja/gn_kegg_ja.html ●BioPaxはパスウェイデータフォーマットの標準化を目指す オープンコミュニティーです。 http://www.biopax.org/ これまでに…

http://enq-maker.com/result/atizHI5 こちらで日々集計中です。 GeneSpringGXでの解析ワークフローで迷われた時の ちょっとした参考にして頂ければ幸いです。